Macromolecole Biologiche
Lo scopo della Sezione AIC sulle Macromolecole Biologiche (BMM) è quello di favorire il progresso di tutti gli aspetti e le applicazioni delle tecniche cristallografiche e di microscopia elettronica in condizioni criogeniche alle proteine, agli acidi nucleici e ai loro complessi, promuovendo al contempo la comunicazione tra i membri dell’AIC attivi o interessati ai vari sviluppi in questi campi.
L’obiettivo del sito web BMM è quello di collegare i gruppi di biologia strutturale e di cristallografia in Italia alle principali infrastrutture europee, ai prossimi incontri scientifici e corsi, ai fornitori, alle opportunità di lavoro e ai pacchetti software specialistici o di uso generale. Miriamo anche a favorire la discussione e lo scambio di idee o materiali, e a promuovere la collaborazione tra i gruppi.
Nulla di questo genere accade senza il continuo e attento contributo della comunità, che è invitata a contribuire con notizie, idee, offerte, ecc. Ciò è particolarmente prezioso in Italia, dove i gruppi di biologia strutturale sono dislocati in Dipartimenti e ambiti scientifici molto diversi, e possono essere relativamente sottodimensionati. Miriamo ad aiutare tutti attraverso queste pagine e il flusso di informazioni ad esse associate.
Tutti i suggerimenti costruttivi per migliorare la nostra comunicazione sono ben accetti. Fateci sapere cosa vorreste vedere in queste pagine, aspettiamo il vostro contributo!
Coordination Board
Stefano Mangani – stefano.mangani@unisi.it – Coordinatore
Rocco Caliandro – rocco.caliandro@cnr.it – editor di contenuti web
Andrea Ilari – andrea.ilari@cnr.it
Marina Mapelli – marina.mapelli@ieo.it
Gruppi di ricerca BMM
Cristallografia di proteine e cryoEM
Dipartimento di scienze biomediche, Università di Padova,
Giuseppe Zanotti, Tito Calì, Paola Berto, Francesca Vallese, Alessandro Grinzato.
Gruppo di Biologia Strutturale
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie, Università di Pavia
Andrea Mattevi, Claudia Binda, Federico Forneris, Francesca Magnani, Stefano Rovida.
Strutture Biomolecolari, Cristallografia di Macromolecole
Dipartimento di Scienze Chimiche, Università di Padova
Roberto Battistutta, Elisa Costanzi, Valentina Furlanetto.
Laboratorio di Cristallografia di Proteine e Structure-Based Drug Design
CIBIO – Dipartimento di Biologia Cellulare, Computazionale e Integrata, Università di Trento
Graziano Lolli, Giulia Cazzanelli, Andrea Dalle Vedove.
Metodi, Diffrazione da raggi X e bioSAXS
CNR – Istituto di Cristallografia, Bari
Giovanni Luca Cascarano, Rocco Caliandro, Dritan Siliqi, Benedetta Carrozzini, Danilo Benny Belviso, Davide Altamura, Cinzia Giannini.
- PDB: 6QUF e 6QUK. Protein crystallization by ionic liquid hydrogel support
- PDB: 6FSW Structure of Archaeoglobus fulgidus SBDS protein at 1.9 Angstrom
- PDB: 5H6Z and 5WW0, Crystal structure of Set7, a novel histone methyltransferaase in Schizossacharomyces pombe
- PDB: 5TZL, Pt(II)-mediated copper-dependent interactions between ATOX1 and MNK1
- SASBDB: SASDET8, GTPase Elongation Factor like-1 bound Shwachman-Diamond Syndrome protein (EFL1*SDo1)
- SASBDB: SASDAC8, SDS hydrolase SdsA1
- SASBDB: SASDEV8, Shwachman-Diamond Syndrome protein (yeast SD01)
- SASBDB: SASDEW8, Shwachman-Diamond Syndrome protein (SD01) with domains 2 and 3
- SASBDB: SASDEU8, GTPase Elongation Factor like-1 protein (yeast EFL1)
Dipartimento di Bioscienze, Università di Milano
Martino Bolognesi, Martina Palamini, Paolo Swuec, Delia Tarantino.
Carlo Camilloni, Cristina Paissoni.
Louise-Gourlay, Stefano De Benedetti, Flavio Di Pisa.
Marco Nardini, Antonio Chaves Sanjuan, Michela Lapi.
Stefano Ricagno, Rosaria Russo, Cristina Visentin, Luca Oberti, Luca Broggini.
CNR – Istituto di Biofisica, Milano
Mario Milani, Eloise Mastrangelo, Michela Bollati, Francesco Boni, Federica Cossu, Matteo De Rosa.
Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”, Università di Firenze
Vito Calderone.
IIT, Centro Nanoscienze e Tecnologia, Milano
Emilio Parisini, Stefano Donini, Tommano Prosdocimi, Chiara Vettraino, Arthimede Torretta, Sara Abbate.
Laboratory of Protein Crystallography and BioXAS. PX for drug discovery
Dipartimento di Biotecnologie, Chimica e Farmacia, Università di Siena
Stefano Mangani, Cecilia Pozzi, Manuela Benvenuti, Giusy Tassone, Federica Carucci, Ludovica Lopresti.
Gruppo di Biocristallografia e Biomineralizzazione
Dipartimento di Chemica “Giacomo Ciamician”, Università di Bologna
Giuseppe Falini, SImona Fermani, Giulia Magnabosco, Devis Montroni, Francesco Lanero, Veronica Bissi, Andrea Condorelli.
- PDB: 6H7G, Crystal structure of redox-sensitive phosphoribulokinase (PRK) from the green algae Chlamydomonas reinhardtii
- PDB: 6H7H, Crystal structure of redox-sensitive phosphoribulokinase (PRK) from Arabidopsis thaliana
- PDB: 6Q46, 6Q47, Crystal structure of thioredoxin h1 from Chlamydomonas reinhardtii
- PDB: 6Q6T, 6Q6U, 6Q6V, Crystal structure of C39S mutant of thioredoxin h1 from Chlamydomonas reinhardtii
- PDB: 6I19, Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii thioredoxin h1
- PDB: 6I1C, Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii thioredoxin f2
- PDB: 5ND5, 5ND6, Crystal structure of apo transketolase from Chlamydomonas reinhardtii
- PDB: 5NLF, 5NLI, 5NMC, 5NL4, 5NL5, 5NLJ, Crystal structure of Zn3-hUb(human ubiquitin) adduct
Gruppo di Biologia Strutturale
CNR – Istituto di Cristallografia, Trieste
Doriano Lamba, Sonia Covaceuszach, Alessandro Pesaresi, Alberto Cassetta.
Istituto Italiano di Tecnologia, CNI@NEST, Pisa
Ganpiero Garau, Eleonora Margheritis, Valentina De Lorenzi, Sara Chiarugi, Elisa Martino.
Laboratorio di Biologia Strutturale Integrata
Istituto Europeo di Oncologia, Milano
Marina Mapelli, Sebastiano Pasqualato, Valentina Cecatiello, Danilo Faccenda, Chiara Gaddoni, Silvia Monzani, Valentina Palmerini, Laura Pirovano, Cristina Renna, Francesca Rizzelli.
Laboratorio di Chimica Bio-Organica e Bio-Cristallografia (B2Cl)
Facoltà di Scienze e Tecnologia, Free University di Bolzano
Stefano Benini, Rosanna Caliandro, Ivan Polsinelli.
- PDB: 6FRW, X-ray structure of the levansucrase from Erwinia tasmaniensis
- PDB: 5O8P, The crystal structure of DfoA bound to FAD, the desferrioxamine biosynthetic pathway cadaverine monooxygenase from the fire blight disease pathogen Erwinia amylovora
- PDB: 5O3Z, Crystal structure of Sorbitol-6-Phosphate 2-dehydrogenase SrlD from Erwinia amylovora
- PDB: 5O5C, The crystal structure of DfoJ, the desferrioxamine biosynthetic pathway lysine decarboxylase from the fire blight disease pathogen Erwinia amylovora
- PDB: 5O7O, The crystal structure of DfoC, the desferrioxamine biosynthetic pathway acetyltransferase/Non-Ribosomal Peptide Synthetase (NRPS)-Independent Siderophore (NIS) from the fire blight disease pathogen Erwinia amylovora
- PDB: 5O8R, The crystal structure of DfoA bound to FAD and NADP; the desferrioxamine biosynthetic pathway cadaverine monooxygenase from the fire blight disease pathogen Erwinia amylovora
- PDB: 5FRK, SeMet crystal structure of Erwinia amylovora AmyR amylovoran repressor, a member of the YbjN protein family
- PDB: 5FR7, Erwinia amylovora AmyR amylovoran repressor, a member of the YbjN protein family
CNR-Istituto di Biologia Molecolare e Patologia e Dipartimento di Scienze Biochimiche, Sapienza Università di Roma
Adele di Matteo, Giorgio Giardina, Annarita Fiorillo, Andrea Ilari, Linda Celeste Montemiglio, Linda Savino, Beatrice Vallone,
Gruppo di Biologia Strutturale
Dipartimento di Scienze Farmaceutiche, Università del Piemonte Orientale, Novara
Menico Rizzi, Davide Maria Ferraris, Silvia Garavaglia, Riccardo Miggiano, Franca Rossi.
- PDB: 5MP7, Crystal structure of phosphoribosylpyrophosphate synthetase from Mycobacterium smegmatis
- PDB: 5HKF, Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis H37Rv orotate phosphoribosyltransferase in complex with 5-phospho-alpha-D-ribosyl 1-diphosphate (PRPP)
- PDB: 5LLQ, Crystal structure of Sulfolobus solfataricus O6-methylguanine methyltransferase C119F variant
- PDB: 5FHZ, Human aldehyde dehydrogenase 1A3 complexed with NAD(+) and retinoic acid
Laboratorio di Biologia Strutturale
Università dell’Aquila, L’Aquila
Francesco Angelucci, Rodolfo Ippoliti, Francesco Giansanti, Matteo Ardini, Luana Di Leandro, Silvestri Ilaria, Francesca Fata,
